Centre d’études d’agents Pathogènes et Biotechnologie pour la Santé (CPBS)

Présentation générale

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  • Thématiques:

    Maladies infectieuses, Bactériologie et virologie, Immunologie, Interactions, aspects moléculaires et cellulaires de la biologie, Pharmacologie

  • Descriptif général:

    Le CPBS arrive aujourd’hui à une étape charnière de son évolution. Son fonctionnement et son image vont être considérablement transformés car pour la première fois toutes les équipes de l’unité sont réunies sur un seul et même site : un bâtiment entièrement neuf au cœur d’un environnement scientifique exceptionnel au niveau de la masse critique et de la qualité des équipes de biologistes qui s’y trouvent.
    Le CPBS va ainsi avoir les moyens de ses ambitions grâce aux infrastructures mises à disposition. Une nouvelle dynamique va se mettre en place au sein de l’unité et à l’intérieur du consortium qu’elle constitue avec le CRBM et l’IGMM.
    Le CPBS fédère depuis 2007 chercheurs, enseignants chercheurs et ITA/IATOS autour de l’étude des agents infectieux (virus et bactéries) et du développement de molécules anti-virales et/ou anti-bactériennes. Il va poursuivre son développement au cours de ce nouveau quadriennal afin de renforcer la bactériologie et l’interface biologie-chimie (pharmacologie) et biologie-physique (approches in-silico). Un appel d’offres international sera lancer en 2011 afin d’accueillir 2 nouvelles équipes de haut niveau.
    Le potentiel de recherche en rétrovirologie et bactériologie, conjugué aux expertises originales en biophysique et pharmacologie contribuent au développement des connaissances sur les relations hôtes-pathogènes au niveau moléculaire, à la lutte contre la résistance des pathogènes aux médicaments et nous permettent de rechercher de nouvelles cibles par la dissection des processus d’interactions hôtes-pathogènes.

  • Expertises, compétences et savoir faire:
    • Test de molécules antivirales
    • Expertises sur préparation vaccinale
    • Expertises en biophysique et pharmacologie
    • Manipulation de pathogènes viraux et bactériens de classe 3
    • Modèles d’infection de cellules eucaryotes
    • Microscopie électronique

Rayonnement

  • Nb de publications / an: 35 dans des revues à comité de lecture
  • Nb de thèses / an: 3
  • Dernières publications majeures:
    1. L. Espert, M. Denizot, M. Grimaldi, V. Robert-Hebmann, B. Gay, M. Varbanov, P. Codogno, M. Biard-Piechaczyk. (2006) Autophagy is involved in T cell death after binding of HIV-1 envelope proteins to CXCR4. J. Clin Invest.116(8):2161-72.
    2. L. Didierlaurent, L. Houzet, J-C. Paillart, Z. Morichaud, F. Smagulova, S. Maurel, R. Marquet, and M. Mougel. (2009) HIV-1 specifically encapsidates other nucleic acids than its genomic RNA. Retrovirology. 6(Suppl 2):31.
    3. D. Fenard, L. Houzet A. Tupin, S. Brun, M. Mougel, C. Devaux, N. Chazal, L. Briant (2009) Uracil DNA Glycosylase 2 negatively regulates HIV-1 LTR transcription. Nucleic Acids Res. 37(18):6008-18.
    4. F. Rayne, S. Debaisieux, H. Yezid, YL Lin, C. Mettling, K. Konate, N. Chazal, ST Arold, M. Pugnière, F. Sanchez, A. Bonhoure, L. Briant, E. Loret, C. Roy, B. Beaumelle. (2010) Phosphatidylinositol-(4,5)-biphiosphate enables efficient secretion of HIV-1 Tat by infected T-cells. EMBO J. 29:1348-62.
    5. L. Papon, A. Oteiza,T. Imaizumi, H. Kato, E. Brocchi, TG Lawson, S. Akira, N. Mechti. (2009) The viral RNA recognition sensor RIG-I is degraded during encephalomyocarditis virus (EMCV) infection. Virology. 393(2):311-8.
    6. F Rayne, S. Debaisieux, A. Bonhoure and B. Beaumelle. (2010) HIV-1 Tat is unconventionally secreted through the plasma membrane. Cell Biol Int. 34(4):409-13.
    7. N. Polakowski, H. Gregory, JM Mesnard, I. Lemasson. (2010) Expression of a protein involved in bone resorption, Dkk1, is activated by HTLV-1 bZIP factor through its activation domain. Retrovirology. 7(1):61.
    8. T. Kinjo, J. Ham-Terhune, JM Peloponese Jr, KT Jeang. (2010) Induction of reactive oxygen species by human T-cell leukemia virus type 1 tax correlates with DNA damage and expression of cellular senescence marker. J. Virol. 84(10):5431-7.
    9. M-P Jimenez de Bagues, S. Ouahrani-Bettache, J-F Quintana, O. Mitjana, N. Hanna, S. Bessoles, F. Sanchez, H. C Scholz, V. Lafont, S. Köhler and A. Occhialini. (2010) The new species Brucella microti replicates in macrophages and causes death in murine models of infection. J. Infect. Diseases. 202(1):3-10.
    10. P. Joseph, F. Turtaut, S. Ouahrani-Bettache, JL. Montero, I. Nishimori, T. Minakuchi, D. Vullo, A. Scozzafava, S. Köhler, JY. Winum, C. Supuran. (2010) Cloning, characterization and inhibition studies of a beta-carbonic anhydrase from Brucella suis. J Med Chem. 53(5):2277-85.
    11. Tupin, M. Gualtieri, JP Leonetti, K. Brodolin. (2010) The transcription inhibitor lipiarmycin blocks DNA fitting into the RNA polymerase catalytic site. EMBO J. 29(15):2527-37.
    12. Varga, C. Lionne, P. Lallemand, J. Szabó, N. Adamek, C. Valentin, M. Vas, T. Barman, L. Chaloin. (2009) Direct kinetic evidence that Lys 215 is involved in the phospho-transfer step of human 3-phosphoglycerate kinase. Biochemistry. 48(29):6998-7008
    13. E. Bernard, M. Solignat, B. Gay, N. Chazal, S. Higgs, C. Devaux, L. Briant. (2010) Endocytosis of chikungunya virus into mammalian cells : role of clathrin and early endosomal compartments. Plos one. 5(7):e11479.
  • Projets et appels d'offres en cours:

    ANR, ANRS, Sidaction

  • Brevets AES:

    9 brevets déposés depuis 2003

  • Labellisations particulières:
    • Pôle de compétitivité Orphème, axe infectiologie
    • RTRS infectiopôle Sud
    • Canceropôle Grand Sud Ouest

Moyens

  • Plateformes technologiques, matériel...:
    • Expérimentation en laboratoire de confinement L3
    • Cytométrie en flux
    • Microscopie électronique
    • Interactions basse température
    • Modélisation moléculaire

Partenariats et collaborations

  • Partenariats et entreprises de référence:

    ANR, ANRS, Sidaction, Ligue nationale contre le cancer, ARC, Oséo

  • Collaborations externes:

    Collaborations avec des équipes espagnole, allemande, hongroise, russe, canadienne, américaine...

Rattachement

UFR associés

Valorisation

  • Jeunes pousses créées, accueillies: Nosopharm SAS, jeune entreprise de biotechnologies, a été créée par deux doctorants du CPBS sur la base de brevets issus de leurs travaux de thèse.
    Pendant 2 ans, une collaboration sous forme d’un laboratoire coopératif a permis au CPBS de tisser des liens étroits avec la société Deinove.

International

  • Accords de coopération scientifique ou pédagogique: Plusieurs équipes du CPBS bénéficient régulièrement de programmes internationaux de coopération scientifique (PICS) avec des équipes canadienne ou espagnole.
 

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